单细胞扩增实验对操作细节要求较高,实验结果会受到样本处理、体系配制等多个环节影响。按照试剂盒配套要求执行标准化操作,能够减少实验过程中的人为偏差,保障实验过程稳定,获取可用的实验数据。整个实验主要分为样本前期准备、样本裂解处理、扩增反应体系配制、上机反应等环节,其中样本裂解与反应体系配制属于实验关键步骤,需要落实对应的实操规范。
开展实验之前,需要完成前期准备工作。实验人员需要做好个人防护,穿戴实验防护用品,对实验操作台进行清洁处理。实验所用的移液器具、耗材需要确认无核酸污染,耗材开封后尽量一次性使用,避免反复取用造成交叉污染。试剂盒内各类组分取出后,放置在合适环境下进行融化,融化过程中避免剧烈摇晃。全部试剂融化完成之后,轻柔颠倒混匀,通过低速离心将管壁附着的液体收集到管底,再放置于冰上待用。实验过程尽量在低温环境下开展,减少试剂组分发生降解。
样本裂解是单细胞扩增实验的前置步骤,直接关系后续扩增效果。实验操作需要在洁净的操作空间内完成,避免环境中的外源核酸进入样本体系。待处理的单细胞样本需要保持状态稳定,操作过程尽量缩短样本在室温下暴露的时间。将单细胞样本转移至裂解反应管内,操作时注意避免样本出现丢失,同时防止样本管内壁沾染多余样本。
加入裂解相关试剂时,移液操作要平稳,试剂需要精准加到反应管底部,不要挂在管壁位置。试剂添加完成之后,轻柔吹打混匀样本与裂解试剂,混匀动作不宜用力过猛,防止产生大量气泡。混匀结束后,做好短暂离心,使管内全部液体汇集到管底。按照试剂盒规定的条件开展裂解孵育,孵育过程中保持环境条件稳定,不要随意挪动反应管。裂解结束之后,反应产物可以短暂置于低温环境暂存,不建议长时间放置,需要尽快进入后续体系配制环节。裂解操作过程中,要区分样本管与阴性对照管,做好标记,避免样本混淆。
扩增反应体系配制需要遵循分区操作原则,试剂配制区域和样本处理区域分开,降低样本之间交叉污染的可能性。配制体系前,再次核对试剂盒各组分状态,确认试剂没有出现分层、沉淀等异常情况。配制体系时,建议在冰盒上进行操作,维持试剂低温状态。
体系配制优先配制预混液,将试剂盒内对应的各类试剂按照操作说明混合在一起。配制预混液的时候,移液要做到动作轻柔,吸取试剂尽量避免产生气泡。每加入一种试剂,完成移液之后可以轻轻吹打混匀,全部试剂添加完毕后,轻柔颠倒混匀预混液,之后进行短暂离心,把管壁上残留液体收集至管底。预混液配制完成之后,按照实验设计,分装到各个反应管当中。
向反应管内加入裂解后的样本产物时,移液枪头需要更换,避免不同样本之间发生交叉污染。样本加入反应管后,轻柔吹打混匀管内液体,混匀之后进行离心,使全部液体汇集到管底。配制完成的反应体系,需要检查管内是否存在气泡,气泡会干扰后续反应进程,如果出现气泡,可以通过低速离心消除。
配制体系的全过程需要做好样本记录,对每一个反应管做好清晰标识,记录样本编号、处理时间等信息。配制结束后,尽快将反应管放置到仪器当中启动扩增反应,减少体系在室温下停留的时长。实验过程中,需要同步设置对照样本,对照样本同样按照相同的操作流程完成体系配制,用于判断实验过程是否存在异常。
实验结束之后,需要对操作台、移液器具进行清洁。剩余试剂按照试剂盒说明进行保存,耗材按照实验废弃物相关要求处理。操作过程中如果出现试剂洒落、样本管破损等情况,需要及时对区域进行清洁处理,防止污染扩散。
在实际实操当中,需要留意一些常见问题。裂解环节如果混匀力度过大,容易造成样本损伤;体系配制时如果产生较多气泡,会影响反应进行。操作时尽量保持动作连贯,减少不必要的反复开盖,降低环境污染物进入反应体系的概率。
标准化的样本裂解与扩增体系配制,是单细胞扩增实验能够顺利开展的基础。严格遵循操作流程,把控每一步的操作细节,能够降低实验干扰因素,保障实验过程的重复性,为后续的数据分析提供可靠的实验基础。